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Bioinformatics and computational biology / bioinformatique et biologie computationnelle, Joint Master

Master HEU

Universität Bern UNIBE > Philosophisch-naturwissenschaftliche Fakultät

Université de Fribourg (UNIFR) > Faculté des sciences et de médecine

Catégories
Lieu de formation

Fribourg (FR) - Berne (BE)

Langue d'enseignement

anglais

Type de formation

Hautes écoles universitaires HEU

Modalités temporelles

À plein temps

Thèmes de formation

Études et formations en informatique - Nature, sciences naturelles

Domaines d'études

Biologie - Informatique - Sciences computationnelles

Swissdoc

6.540.1.0 - 6.561.1.43 - 6.160.13.0

Mise à jour 25.08.2022

Description

Description de la branche d'études

Le Master of Science in Bioinformatics and Computational a pour but d’enseigner aux étudiant-e-s comment analyser et modéliser informatiquement les données issues du séquençage du génome humain. Aussi, ce cursus forme-t-il des scientifiques ayant des compétences en biologie et en informatique capables d’extraire les informations pertinentes de cette masse de données.

Description de la formation

Le master est le deuxième cursus de la formation de base universitaire, après le bachelor et équivaut à l'acquisition de 90 à 120 crédits ECTS. 

Le master of Science in Bioinformatics and Computational demande l'acquisition de 120 crédits ECTS.

Le Master of Science in Bioinformatics and Computational Biology est un programme interdisciplinaire, dispensé exclusivement en anglais, et organisé conjointement par l'Université de Fribourg et l'Université de Berne.

Le programme d'études du premier semestre s'appuie sur votre expertise préalable en biologie, biochimie ou sciences de la vie, ou alors en mathématiques, en informatique ou en physique, et complète votre profil grâce à des cours taillés sur mesure en programmation informatique, en statistiques ou en biologie fondamentale. Au deuxième semestre, vous vous concentrerez sur les principaux thèmes de la bioinformatique et de la biologie computationnelle, en l'occurrence la gestion des données, l'analyse de séquences de données, la modélisation de systèmes biologiques, l'analyse d'images et la biologie systémique. Les compétences ainsi acquises seront renforcées par un enseignement pratique intensif. Le troisième semestre sera consacré à votre propre projet de recherche, que vous mènerez dans un laboratoire de recherche internationalement reconnu à l'Université de Fribourg ou de Berne. Vous pourrez également mener votre projet en collaboration avec un institut partenaire (p. ex. l'Institut suisse de bioinformatique), ou une autre institution du secteur public ou privé.

Plan de la formation

Bioinformatics and Computational Biology, MA (120 ECTS)

1 crédit ECTS correspond à environ 25-30 heures de travail. 

  ECTS
The goal of these modules is to homogenize the knowledge of all students. Therefore, students with a BSc in biology, biochemistry, life sciences or equivalent follow the module “Preparatory Computer Science”. Students with a BSc in mathematics, statistics, computer science or equivalent follow the module “Preparatory Biology”.  
Preparatory modules  
Module A “Preparatory Computer Science” *)  
Introduction to UNIX and BASH (lecture with exercises), (Studienort Fribourg) 2.5
Basic programming for non-informaticians 5
  7.5
Module B “Preparatory Biology” *)  
Molecular biology and genetics for non-biologists (lecture) 4
Molecular biology and genetics for non-biologists (practical) 3,5
  7.5
*) Only one of the preparatory modules can be chosen  
   
Compulsory Modules  
Module “Computer Science”  
Introduction to R (Studienort Fribourg) 2
Programming with R (Studienort Fribourg) 1
Introduction to Digital Sustainability 1
Introduction to High-Performance Computing 1
Advanced Python 2.5
Introduction to Signal and Image Processing 5
Bioinformatic Algorithms 3
  15.5
Module “Statistics”  
Applied biostatistics I (lecture with exercises)  4
Applied biostatistics II (lecture with exercises) 4
Machine Learning (Studienort Fribourg) 5
Stochastic models in bioinformatics (Studienort Fribourg) 3
Deep Learning in Life Science 5
  21
Module “Genomics”  
Bioinformatics (practical course, in silico), (Studienort Fribourg) 3
RNA-Sequencing 3
Cancer Genomics 3
Evolutionary Genomics (Studienort Fribourg) 3
Genome Assembly 2
Organization and annotation of Eukaryote genomes (Studienort Fribourg) 3
Genomics of Microorganisms 1.5
Metagenomics Data Analysis (Studienort Fribourg) 1
  19.5
Module “Bioinformatic Applications”  
Research Seminar in Bioinformatics (Studienort Fribourg & Bern) 2
Proteomics and Metabolomics 5
Classical Models in Biology (lecture), (Studienort Fribourg) 3
Classical Models in Biology (exercises), (Studienort Fribourg) 1
Epidemiology 1.5
Systems Biology 3
Precision Medicine 3
  18.5
Module “Elective courses”  
Term project °) 3
Term project °) 4
Term project °) 5
Data Processing and Visualization 6
Pattern recognition 5
Introduction to Protein Structure and Protein Homology Modelling (Studienort Fribourg) §) 1.5
Introduction to Docking of Small Molecules to Large Macromolecules and Molecular Graphic (Studienort Fribourg)  §) 1.5
Structure and Functions of Host-associated Microbiota (Studienort Fribourg)
Molecular Genetics of Model Organism development (Studienort Fribourg) 3
Programmierung 1 *) 5
Beyond genetic inheritance *) 3
Seminar and journal club in Population genetics and Bioinformatics *) 2
Four weeks research project *) 7.5
Master thesis 30
Total Master  20

°)Only one Term project can be chosen
*) Course offered by the University of Bern
§) Must be taken together

If requested by a student, the study advisor can recognize courses taken at other universities for up to 10 ECTS credits.

Lien sur le plan de la formation

Combinaison des branches

Le programme d'études "Bioinformatique et biologie computationnelle, Master" ne permet pas de combinaison de branches.

Description en branche secondaire ou hors faculté

Bioinformatics and computational biology ne sont pas proposées en tant que programme secondaire.

Admission

Conditions d’admission

Admission directe

Sont admis sans autres conditions à ce master les titulaires d'un diplôme de bachelor en:

  • Biologie
  • Sciences de la vie
  • Mathématiques/Statistiques
  • Informatique/Bioinformatique
  • Sciences computationnelles
  • Physique

Les titulaires d'un diplôme de bachelor universitaire suisse ou étranger, reconnu et jugé équivalent par l'Université de Fribourg, qui ne remplissent pas cette condition peuvent être admis aux études de master avec des conditions préalables (à accomplir avant l'entrée en master) et/ou des compléments (à accomplir au cours des études de master). Ces prestations d'études ne doivent pas dépasser 60 crédits ECTS au total. Il en va de même des titulaires d'un diplôme de bachelor d'une Haute école spécialisée suisse, selon les conventions en vigueur.

Plus d'informations pour les titulaires d'un passeport suisse ou étranger: Admission - vue d'ensemble.

La haute école est responsable pour l'admission (voir "Liens sur l'admission").

Lien sur l'admission

Inscription

 Délais d’inscription 

  • semestre d’automne : 30 avril
  • semestre de printemps : 30 novembre

Diplôme

  • Master haute école universitaire HEU

Master of Science in Bioinformatics and Computational Biology, Université de Fribourg / Université de Berne

Débouchés

3e cycle et études postgrades

Pour plus de détails, consulter les fiches des formations postgrades.

Doctorat / PhD

La Faculté des sciences décerne, aux titulaires préalables d'un master, le titre de Docteur-e (Dr sc.) sur la base d'un travail scientifique (thèse) et d'une soutenance de thèse.

Infos pratiques

Lieu / adresse

  • Fribourg (FR)
  • Berne (BE)

Déroulement temporel

Début des cours

Semestre d'automne

Durée de la formation

4 semestres

Modalités temporelles

  • À plein temps

Langue d’enseignement

  • anglais

All courses of the MSc programme in Bioinformatics and Computational Biology are taught in
English. Also, all exams and written work (e.g. Master’s thesis) have to be in English.

Liens

Renseignements / contact

Université de Fribourg

Prof. Daniel Wegmann: daniel.wegmann@unifr.ch 

Université de Berne

Jolanda Paganoni Zurbrügg: jolanda.paganoni@bioinformatics.unibe.ch

orientation.ch